Instalasi Gawat Darurat (IGD) RS Siti Khodijah dilengkapi dengan tenaga medis yang handal serta peralatan medis yang siap selama 24 jam untuk menangani kasus gawat darurat. Selain itu, IGD RS Siti Khodijah juga menyediakan ambulans berikut dengan tim yang mencakup dokter, perawat dan paramedik guna memudahkan transportasi pasien.